Manga ini mengisahkan seorang gadis SMU bernama Honda Tohru yang yatim piatu karena baru saja ibunya meninggal setelah mengalami kecelakaan mobil. Touru tinggal bersama kakeknya, tetapi ketika keluarganya pindah dan merenovasi rumahnya, Touru terpaksa tinggal di tenda dengan tidak memberi tahu sahabatnya dan bekerja untuk menghidupi dirinya.
Suatu hari, Tohru tiba di rumah yang dikelilingi pohon-pohon yang ternyata rumah Yuki Sohma, siswa populer di sekolahnya, dan Shigure Sohma, sepupu Yuki. Ketika keluarga Sohma mengetahui Tohru sebenarnya tinggal di tenda, mereka terkejut. Tohru tetap ingin tinggal di tenda sehingga menawarkan akan membayar sewa tanah yang digunakannya karena seluruh area tersebut milik keluarga Sohma. Merasa kasihan, Sohma mengizinkan Tohru untuk tinggal di rumah mereka dan sebagai balasannya Tohru bersedia mengurus rumah dan memasak.
Pada suatu hari, Kyo Sohma, sepupu Yuki, datang ke rumah mereka dan menantang Yuki bertengkar. Tetapi, tidak sengaja Kyo memeluk Tohru dan berubah menjadi kucing. Shigure dan Yuki yang tidak sengaja memeluk Tohru juga berubah menjadi anjing dan tikus. Dan akhirnya Tohru mengetahui rahasia keluarga Sohma, yaitu, 13 anggota keluarga Sohma dapat berubah menjadi binatang-binatang dalam dalam Shio Cina. Kemudian, kisah tentang Tohru yang mengetahui rahasia keluarga Sohma pun tersebar di keluarga Sohma. Lama-kelamaan, Tohru mengenal dan mengetahui keadaan para anggota keluarga Sohma, dan disukai banyak anggota keluarga Sohma. Bahkan dia bisa meluluhkan hati sang dewa "Akito".